MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 1345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	CAA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022047	TAAA	2	8	92	99	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022047	AT	3	6	112	117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022047	TTGA	2	8	121	128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022047	A	6	6	165	170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022047	AT	3	6	203	208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022047	AGATAA	2	12	213	224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022047	GTT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022047	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022047	AGG	2	6	278	283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022047	TTG	2	6	332	337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022047	G	6	6	427	432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022047	GTT	2	6	463	468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022047	GTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022047	AGG	2	6	550	555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022047	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
17	NC_022047	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	530314123
18	NC_022047	GATA	2	8	641	648	50 %	25 %	25 %	0 %	530314123
19	NC_022047	GTA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314123
20	NC_022047	AAG	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314123
21	NC_022047	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
22	NC_022047	ATTA	2	8	776	783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022047	AGG	2	6	785	790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022047	GAT	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
25	NC_022047	ATT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314124
26	NC_022047	AAT	2	6	881	886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314124
27	NC_022047	GAAT	2	8	948	955	50 %	25 %	25 %	0 %	530314124
28	NC_022047	CTT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314124
29	NC_022047	TGC	2	6	988	993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314124
30	NC_022047	TAC	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314124
31	NC_022047	ATC	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314124
32	NC_022047	GTA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
33	NC_022047	ATGG	2	8	1232	1239	25 %	25 %	50 %	0 %	530314124
34	NC_022047	GAT	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
35	NC_022047	GTT	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314124
36	NC_022047	AAG	3	9	1320	1328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314124
37	NC_022047	AGATG	2	10	1354	1363	40 %	20 %	40 %	0 %	530314124
38	NC_022047	AAT	2	6	1376	1381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314124
39	NC_022047	TA	3	6	1391	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022047	TAA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022047	TGA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022047	AAATC	2	10	1483	1492	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022047	GAAC	2	8	1500	1507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022047	AG	3	6	1553	1558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022047	TTA	2	6	1709	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314125
46	NC_022047	TATT	2	8	1778	1785	25 %	75 %	0 %	0 %	530314125
47	NC_022047	CTT	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314125
48	NC_022047	A	6	6	1850	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	530314125
49	NC_022047	AGG	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314125
50	NC_022047	TCG	2	6	1925	1930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314125
51	NC_022047	T	6	6	2079	2084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022047	TTTG	2	8	2133	2140	0 %	75 %	25 %	0 %	530314126
53	NC_022047	CGA	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314126
54	NC_022047	T	6	6	2355	2360	0 %	100 %	0 %	0 %	530314126
55	NC_022047	TCA	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022047	GAT	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022047	T	7	7	2503	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	530314127
58	NC_022047	TTC	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
59	NC_022047	GA	3	6	2558	2563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314127
60	NC_022047	CGTA	2	8	2632	2639	25 %	25 %	25 %	25 %	530314127
61	NC_022047	TA	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	530314127
62	NC_022047	TCT	3	9	2801	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
63	NC_022047	TTC	3	9	2824	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
64	NC_022047	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314127
65	NC_022047	GTTTT	2	10	2909	2918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022047	GAC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022047	CCA	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022047	T	6	6	2951	2956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022047	T	7	7	2962	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022047	A	7	7	2971	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022047	CCA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022047	ACT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022047	TAT	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022047	ACTA	2	8	3166	3173	50 %	25 %	0 %	25 %	530314111
75	NC_022047	ACT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
76	NC_022047	AAT	2	6	3219	3224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
77	NC_022047	ACA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
78	NC_022047	TA	3	6	3343	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	530314111
79	NC_022047	ACA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
80	NC_022047	CAT	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
81	NC_022047	TGT	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314111
82	NC_022047	ATC	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
83	NC_022047	AGC	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
84	NC_022047	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314111
85	NC_022047	CGCCTG	2	12	3806	3817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	530314111
86	NC_022047	ATC	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
87	NC_022047	ATCA	2	8	3902	3909	50 %	25 %	0 %	25 %	530314111
88	NC_022047	ATTA	2	8	3986	3993	50 %	50 %	0 %	0 %	530314111
89	NC_022047	TGA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314111
90	NC_022047	CAG	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
91	NC_022047	TTC	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314111
92	NC_022047	ATA	2	6	4080	4085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
93	NC_022047	GAC	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
94	NC_022047	T	6	6	4176	4181	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
95	NC_022047	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
96	NC_022047	ATC	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
97	NC_022047	CATAC	2	10	4324	4333	40 %	20 %	0 %	40 %	530314111
98	NC_022047	T	6	6	4399	4404	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
99	NC_022047	ACA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
100	NC_022047	TTA	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314111
101	NC_022047	CAA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
102	NC_022047	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
103	NC_022047	TTC	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314111
104	NC_022047	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
105	NC_022047	TTGC	2	8	4726	4733	0 %	50 %	25 %	25 %	530314111
106	NC_022047	CAG	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
107	NC_022047	TGAAGC	2	12	4760	4771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530314111
108	NC_022047	TAA	3	9	4813	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
109	NC_022047	CAA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
110	NC_022047	ATG	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314111
111	NC_022047	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
112	NC_022047	T	6	6	5163	5168	0 %	100 %	0 %	0 %	530314128
113	NC_022047	CAA	2	6	5397	5402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314128
114	NC_022047	CTACTT	2	12	5403	5414	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530314128
115	NC_022047	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314128
116	NC_022047	TCC	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022047	TGA	3	9	5487	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314129
118	NC_022047	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	530314129
119	NC_022047	ATCA	2	8	5554	5561	50 %	25 %	0 %	25 %	530314129
120	NC_022047	CAAGA	2	10	5628	5637	60 %	0 %	20 %	20 %	530314129
121	NC_022047	T	7	7	5680	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	530314129
122	NC_022047	CTG	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314129
123	NC_022047	TCC	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314129
124	NC_022047	TAG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314129
125	NC_022047	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314129
126	NC_022047	AAT	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314129
127	NC_022047	ATT	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314130
128	NC_022047	CAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314130
129	NC_022047	CAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314130
130	NC_022047	CTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314130
131	NC_022047	CAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314130
132	NC_022047	TAC	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314130
133	NC_022047	A	6	6	6040	6045	100 %	0 %	0 %	0 %	530314130
134	NC_022047	T	6	6	6121	6126	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
135	NC_022047	AAT	2	6	6127	6132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314130
136	NC_022047	T	6	6	6135	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
137	NC_022047	CTG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314130
138	NC_022047	ATA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314130
139	NC_022047	GAT	2	6	6444	6449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022047	A	7	7	6463	6469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022047	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022047	ATC	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022047	CTA	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022047	TAG	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_022047	GATA	2	8	6669	6676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_022047	TGT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_022047	T	7	7	8435	8441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022047	TCAAT	2	10	8494	8503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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